La Secretaría de Educación Intercultural Bilingüe y la Etnoeducación es la entidad encargada de visibilizar y fortalecer la cosmovisión, saberes y lengua de las 14 nacionalidades del país y el pueblo afrodescendiente, a través de la enseñanza-aprendizaje de los modelos educativos: MOSEIB – Modelo del Sistema de Educación Intercultural Bilingüe y METAFE – Modelo Etnoeducativo Afroecuatoriano. En un total de 1736 instituciones, entre Unidades Educativas Comunitarias Interculturales Bilingües, Unidades Educativas Guardianas de los Saberes y los Centros Educativos Comunitarios Interculturales Bilingües, se implementa la educación de los pueblos y las nacionalidades en todos los niveles y modalidades, a nivel nacional. Entre sus servicios está la capacitación docente, certificación de suficiencia lingüística y la gestión de becas y prácticas pre profesionales para docentes y estudiantes de sistema intercultural bilingüe.